Le Comité syndical est l'instance décisionnaire du SYTRAL. Les grandes orientations sont votées par délibération lors de séances qui ont lieu en moyenne toutes les six semaines.
Le Comité syndical du SYTRAL est composé de 26 élus issus de deux assemblées
16 élus de la Communauté urbaine de Lyon, dont le Président :
10 élus du Conseil général du Rhône, dont le Vice-président :
Le bureau exécutif est composé de 8 représentants du Comité syndical : > 5 élus communautaires, dont le Président > 3 conseillers généraux, dont le Vice-président